يدرس الطالب في هذا المستوى ما يؤسس به عقيدته، وينمي فيه حب شعائر الإيمان، عبر دراسة ثلاثة مواد دراسية صممت من قبل فريق إعداد المناهج في أكاديمية هوية الجيل لتناسب الفئة العمرية المستهدفة، ويدسر الطالب فيها المواد الشرعية التالية:

فإذا أخذ الطالب أساسات العقيدة، وسقي من منبع الوحيين، فتعرف على أحكام الصلاة، وسنن الوضوء وواجباته، شرع في تقوية جذور الإيمان في المستوى الدراسي الثاني، آخذا طريقه في التعرف على سيرة المصطفى صلى الله عليه وسلم والاتقداء بهديه واقتفاء أثره، ليمر على المواد الدراسية التالية

فإذا ثبتت الجذور وبدأ الطالب يسير في طاعة الله مستعينا به متوكلا عليه، وصل إلى مرحلة البناء، بناء حاجز الوقاية من الشهوات، والوساوس المهلكات، ليثبت على طاعته ولا يزل الشيطان قدمه بعد ثبوتها، ويدرس الطالب في هذه المرحلة الكتب الدراسية التالية:

ويستمر العطاء وسقاء الروح والإيمان، حتى تصبح حياته مبنية على حب الرحمن، فهنا نأخذ بيد الطالب لنمر معه على سير الصحابة الكرام والأئمة العظام لنقف على أيامهم ونتعلم من أخبارهم ما نقوي به عقيدة أبنائنا ويزيدهم قربا من الله، وتشمل هذه المرحلة الكتب الدراسية التالية:

فإذا أتم المستويات الخمسة الأولى وظهرت ثمار هذا العلم الذي كان يطالع ويدرس خلال رحلته في أكاديمية هوية الجيل، أتى ليزداد بصيرة، ويضاء دربه بدراسة أمور عقيدته تفصيلا وببيانا ليمر في هذا المستوى بالمواد الدراسية التالية:

وفي آخر محطات رحلة الطالب في برنامج بذور، وبعد أن أخذ من كل علم بطرف، وبنى فيها أساسات يبني عليها في رحلة طلب العلم التي ستصحبه في هذه الحياة، يترك له العناة لينطلق في أحد العلوم ويرشد ليسجل في برنامج أكثر شمولية حتى يصنع أثرا ويحي علما، ويدرس في هذا المستوى المناهج التالية: